Arrivato nel 1748 a
Salisburgo per studiare, fu tenore di corte dal 1760 al 1796. Sostenne il ruolo dello Spirito Cristiano nel
Singspiel sacro
Die Schuldigkeit des ersten Gebots K 35 di Mozart, e fu forse il primo Don Polidoro nella
Finta semplice K 51; nel 1775 cantò probabilmente nel
Re pastore K 208. Secondo quanto riportato da Benedikt Pillwein, nel suo
Biographische Schilderungen oder Lexikon salzburgischer, theils verstorbener, theils lebender Künstler (Salisburgo, 1821), avrebbe dato lezioni di musica a Mozart, ma non ci sono ulteriori evidenze della sua affermazione. La sua seconda moglie, citata nella corrispondenza familiare, fu
Maria Anna Englhart, sposata il 12 novembre 1760. La loro figlia Maria Elisabeth Bernardina (Salisburgo, 20 agosto 1763), morì alla nascita. Bibl.:
Rainer, «F.A. Spitzeder als Klavierlehrer am Kapellhaus»;
Schuler, «Der Hoftenorist Franz Anton Spitzeder»;
Schuler, Mozarts Salzburger Freunde und Bekannte, pp. 156-159.